| 名称 | 資産数 | 写真 | 構成資産 | 所在地 | 登録年月 |
| 法隆寺地域の仏教建造物 | 2 | 法隆寺 | 奈良県 | 1993年12月 | |
| 法起寺 | |||||
| 姫路城 | 姫路城 | 兵庫県 | 1993年12月 | ||
| 古都京都の文化財 | 17 | 賀茂別雷神社(上賀茂神社) | 京都府 滋賀県 | 1994年12月 | |
| 賀茂御祖神社(下鴨神社) | |||||
| 教王護国寺(東寺) | |||||
| 清水寺 | |||||
| 延暦寺 | |||||
| 醍醐寺 | |||||
| 仁和寺 | |||||
| 平等院 | |||||
| 宇治上神社 | |||||
| 高山寺 | |||||
| 西芳寺(苔寺) | |||||
| 天龍寺 | |||||
| 鹿苑寺(金閣寺) | |||||
| 慈照寺(銀閣寺) | |||||
| 龍安寺 | |||||
| 本願寺(西本願寺) | |||||
| 二条城 | |||||
| 白川郷・五箇山の合掌造り集落 | 3 | 岐阜県白川村荻町 | 岐阜県 富山県 | 1995年12月 | |
| 富山県平村相倉 | |||||
| 富山県上平村菅沼 | |||||
| 原爆ドーム | 原爆ドーム | 広島県 | 1996年12月 | ||
| 厳島神社 | 厳島神社 | 広島県 | 1996年12月 | ||
| 古都奈良の文化財 | 8 | 東大寺 | 奈良県 | 1998年12月 | |
| 興福寺 | |||||
| 春日大社 | |||||
| 春日山原始林 | |||||
| 元興寺 | |||||
| 薬師寺 | |||||
| 唐招提寺 | |||||
| 平城宮跡 | |||||
| 日光の社寺 | 3 | 東照宮 | 栃木県 | 1999年12月 | |
| 二荒山神社 | |||||
| 輪王寺 | |||||
| 琉球王国のグスク及び関連遺産群 | 9 | 今帰仁城跡 | 沖縄県 | 2000年12月 | |
| 座喜味城跡 | |||||
| 勝連城跡 | |||||
| 中城城跡 | |||||
| 首里城跡 | |||||
| 園比屋武御嶽石門 | |||||
| 玉陵 | |||||
| 識名園 | |||||
| 斎場御嶽 | |||||
| 紀伊山地の霊場と参詣道 | 20 | 吉野山 | 奈良県 和歌山県 三重県 | 2004年6月 | |
| 吉野水分神社 | |||||
| 金峯神社 | |||||
| 金峯山寺 | |||||
| 吉水神社 | |||||
| 大峰山寺 | |||||
| 熊野本宮大社 | |||||
| 熊野速玉大社 | |||||
| 熊野那智大社 | |||||
| 青岸渡寺 | |||||
| 那智大滝 | |||||
| 那智原始林 | |||||
| 補陀洛山寺 | |||||
| 金剛峯寺 | |||||
| 丹生都比売神社 | |||||
| 慈尊院 | |||||
| 丹生官省符神社 | |||||
| 熊野参詣道 | |||||
| 大峯奥駈道 | |||||
| 高野山町石道 | |||||
| 石見銀山遺跡とその文化的景観 | 3 | 銀鉱山跡と鉱山町 | 島根県 | 2007年6月 | |
| 街道 (石見銀山街道) | |||||
| 港と港町 | |||||
| 平泉 - 仏国土(浄土)を表す建築・庭園及び考古学的遺跡群 | 5 | 中尊寺 | 岩手県 | 2011年5月 | |
| 毛越寺 | |||||
| 観自在王院跡 | |||||
| 無量光院跡 | |||||
| 金鶏山 | |||||
| 富士山-信仰の対象と芸術の源泉 | 25 | 富士山域 | 山梨県 静岡県 | 2013年6月 | |
| 富士山本宮浅間大社 | |||||
| 山宮浅間神社 | |||||
| 村山浅間神社 | |||||
| 須山浅間神社 | |||||
| 冨士浅間神社 | |||||
| 河口浅間神社 | |||||
| 冨士御室浅間大社 | |||||
| 御師住宅(旧外川家住宅) | |||||
| 御師住宅(小佐野家住宅) | |||||
| 山中湖 | |||||
| 河口湖 | |||||
| 忍野八海(出口池) | |||||
| 忍野八海(お釜池) | |||||
| 忍野八海(底抜池) | |||||
| 忍野八海(銚子池) | |||||
| 忍野八海(涌池) | |||||
| 忍野八海(濁池) | |||||
| 忍野八海(鏡池) | |||||
| 忍野八海(菖蒲池) | |||||
| 船津胎内樹型 | |||||
| 吉田胎内樹型 | |||||
| 人穴富士講遺跡 | |||||
| 白糸ノ滝 | |||||
| 三保松原 |
| 名称 | 資産数 | 写真 | 構成資産 | 所在地 | 登録予定年月 |
| 武家の古都・鎌倉 | 神奈川県 | 1992年暫定リスト登録 2012年推薦書提出 2013年推薦取り下げ | |||
| 彦根城 | 滋賀県 | 1992年暫定リスト登録 | |||
| 富岡製糸場と絹産業遺産群 | 群馬県 | 2007年暫定リスト登録 2013年推薦書提出 2014年審議予定 | |||
| 飛鳥・藤原の宮都とその関連資産群 | 奈良県 | 2007年暫定リスト登録 | |||
| 長崎の教会群とキリスト教関連遺産 | 長崎県 熊本県 | 2007年暫定リスト登録 2015年審議候補 | |||
| 国立西洋美術館(本館) ※「ル・コルビュジエの建築と都市計画」として6ヵ国で共同推薦 | 東京都 | 2007年暫定リスト登録 2008年推薦書提出 2009年情報照会と判定 2011年推薦書再提出 2011年継続審議と判定 | |||
| 北海道・北東北を中心とした縄文遺跡群 | 北海道 青森県 岩手県 秋田県 | 2009年暫定リスト登録 | |||
| 九州・山口の近代化産業遺産群 | 岩手県 静岡県 山口県 福岡県 佐賀県 長崎県 熊本県 鹿児島県 | 2009年暫定リスト登録 2015年審議候補 | |||
| 宗像・沖ノ島と関連遺産群 | 福岡県 | 2009年暫定リスト登録 | |||
| 金を中心とする佐渡鉱山の遺産群 | 新潟県 | 2010年暫定リスト登録 | |||
| 百舌鳥・古市古墳群 | 大阪府 | 2010年暫定リスト登録 | |||
| 平泉-仏国土(浄土)を表す建築・庭園及び考古学的遺跡群- (拡張申請) | 岩手県 | 2012年暫定リスト登録 |